水利学院是华北水利水电大学成立最早、实力最强的学院之一，始建于1951年。 学院拥有水利工程一级学科博士学位授权点和博士后科研流动站， 水利工程学科为河南省特色骨干学科（A类）。学院致力于培养水利水电领域的高层次人才， 为国家水利事业和经济社会发展做出了重要贡献。
地球科学与工程学院是学校以地质、测绘、土木为特色的工科学院。 学院拥有地质资源与地质工程一级学科硕士学位授权点， 地质工程为河南省重点学科。学院坚持"厚基础、宽口径、重实践"的人才培养理念， 为国家基础设施建设和资源开发输送了大批优秀人才。
机械学院是学校最早设立的工科院系之一，拥有机械工程一级学科硕士学位授权点。 学院立足河南、面向全国，围绕装备制造、智能制造、新能源汽车等国家战略新兴产业， 培养具有创新能力和工程实践能力的高素质机械工程人才。
电力学院是学校以电气工程、控制科学与工程、动力工程为核心的工科学院。 学院拥有电气工程一级学科硕士学位授权点，电气工程及其自动化专业为国家级一流专业。 学院面向电力行业和新能源领域，培养理论基础扎实、工程实践能力强的应用型人才。
信息工程学院是学校重点发展的工科学院之一，致力于培养计算机科学、 软件工程和人工智能领域的高素质人才。学院拥有计算机科学与技术一级学科硕士学位授权点， 计算机科学学科进入ESI全球排名前1%。学院以"新工科"建设为引领，深化产教融合， 与多家知名IT企业建立了联合实验室和人才培养基地。
管理与经济学院是学校人文社科领域的重点学院，拥有管理科学与工程、 工商管理两个一级学科硕士学位授权点。学院秉承"管理强国、经济惠民"的办学理念， 立足水利行业特色，培养具有国际视野和创新精神的高级管理人才和经济学人才。